Ну при обновлении приложения оно вполне может подправлять свои настройки. Логика в том, что если у новой версии появляются новые настройки или исчезают старые, то их однозначно надо подправлять. Ну а попутно и все остальные тоже можно.
А этот большой брат очень хочет за тобой следить, вот и включает всё обратно..